观察5公斤玉石的种水，首先需要关注其透明度。种水好的玉石通常具有较高的透明度，光线能够深入其中，显得晶莹透亮。此外，还需要观察玉石的质地和光泽，种水优良的玉石往往质地细腻，光泽温润。在观察时，最好使用手电筒等光源从不同角度照射玉石，以便更全面地评估其种水质量。当然，对于种水的判断还需要一定的经验和专业知识，建议咨询专业的玉石鉴定师或商家进行更准确的评估。