公证5万存款时，一般来说，存款的持有人需要亲自到场。这是因为公证过程需要验证存款人的身份，并确认其对存款的所有权。同时，存款人需要提供相关的身份证明和存款证明文件。

如果存款人因特殊情况无法到场，也可以委托他人代为办理，但这时需要提供有效的委托书和代理人的身份证明。所以，无论是存款人本人还是代理人，都需要在公证时到场。