如果备案时间和住院时间不一样，需要在报销时提供相关证明文件以证明住院时间。例如，可以提供医院的住院记录、发票等文件，以确保报销的准确性。同时，需要按照相关规定提交报销申请，并按照程序进行审核和处理，以确保报销的合法性和规范性。在报销过程中，需要注意保留好相关证明文件，以备后续需要使用或查询。