晋惠保不能保12种病的原因是这些疾病的治疗费用较高，而晋惠保的保额有限，无法承担这些高额费用。

另一方面，这些疾病的治疗过程较长，需要较长的住院时间，而晋惠保的住院天数也是有限制的，无法满足治疗需要。

除了治疗费用和住院天数的原因外，还有其他因素也会影响晋惠保的保障范围。